Amber26 (PMEMD26, AmberTools26)を導入しました
Amber26 (PMEMD26, AmberTools26)を導入しました。今回から PMEMD と AmberTools は別パッケージとして導入しています。
PMEMD26 は update 2 まで適用済です。
AmberTools26 は update 1 まで適用済です。
ジョブサンプルは以下にあります。
- PMEMD 26u2: /apl/pmemd/26u2/samples
- AmberTools 26u1: /apl/ambertools/26u1/samples
モジュールについてはそれぞれ pmemd/26u2, ambertools/26u1 という名前で登録していますが、過去との互換性を考えて amber/pmemd/26u2, amber/tools/26u1 という別名も用意しています。
インストールの詳細については以下のリンクをご確認ください。
- PMEMD 26u2: https://ccportal.ims.ac.jp/node/4009
- AmberTools 26u1: https://ccportal.ims.ac.jp/node/4003