計算機利用の手引き

最終更新: 2024/11/12

以前のマニュアルはこちらにあります。

• クイックスタートガイド
• FAQ (一般・分子科学)
• 利用上の注意点

• システムの全体像

• ジョブの投入方法(jsub)
• Gaussian ジョブの投入方法(g16sub, g09sub)
• ジョブの状況確認(jobinfo)
• ジョブの削除(jdel)

• jobtype、キュー構成、キュー係数、CPU点数
• ディスク領域について

• アプリケーションのビルド(コンパイラとライブラリ)
• 並列プログラムのビルドと実行
• Environment Modules の利用
• Apptainer(Singularity)コンテナの利用

• RCCS固有コマンド
  • CPU 点数やディスクの使用状況確認(showlim)
  • 実行済ジョブの情報取得(joblog)
  • ジョブの待ち時間予測(waitest)
  • 次回メンテナンスまでの時間を表示する(next-maintenance)
  • ジョブの保留(ホールド; jhold)と保留解除(リリース; jrls)
  • 計算ノード上のファイル操作(remsh)

• グループメンバーの追加、削除 => メンバー管理申請
• CPU点数やディスク容量の追加 => 資源追加申請
• 海外への出張中にアクセスしたい => 日本国外からのSSH接続申請
• メンバーのリソース制限をしたい => リソース制限(要ログイン)
  • 代表者のみが実行可能です。CPU 数, GPU 数, CPU 点数, ディスク使用量を制限できます

• 既知の問題
• Tips
  • コマンドライン操作について
  • jsub ヘッダー(select)のサンプル
  • サンプルジョブの実行
  • Python, Ruby 環境について
  • パッケージプログラム一覧(分子科学)
  • アプリケーションライブラリの構築方法