OpenMolcas v21.10
ウェブページ
https://gitlab.com/Molcas/OpenMolcas
バージョン
v21.10
ビルド環境
- Intel Compiler 19.1.2 (intel parallel studio 2020 update 2)
- Intel MKL 2020.0.2 (intel parallel studio 2020 update 2)
- OpenMPI 3.1.0
- cmake 3.16.3
ビルドに必要なファイル
- OpenMolcas.tar.gz
- release の tarball をダウンロード・展開した場合、 git submodule 等のコマンドが通らなかったため、以下のように作った上で tarball 化
[user@ccfep v21.10]$ git clone https://gitlab.com/Molcas/OpenMolcas.git
[user@ccfep v21.10]$ cd OpenMolcas
[user@ccfep OpenMolcas]$ git tag
molcas-8.4
molcas-8.4-sp1
v18.09
v19.11
v20.10
v21.02
v21.06
v21.10
[user@ccfep OpenMolcas]$ git checkout refs/tags/v21.10
[user@ccfep OpenMolcas]$ cd ../
[user@ccfep v21.10]$ tar zcvf OpenMolcas.tar.gz OpenMolcas/
- ga-5.8.zip (Global Arrays)
- /local/apl/lx/openmolcas21.10/ga-5.8 にシンボリックリンクを作成し、v20.10 時のものを流用しています。
ビルド手順
(GlobalArrays については /local/apl/lx/openmolcas21.10/ga-5.8 に v20.10 時のものを指すシンボリックリンクを事前作成しています。)#!/bin/sh
VERSION=v21.10
SOURCEDIR=/home/users/${USER}/Software/OpenMolcas/${VERSION}
TARBALL=${SOURCEDIR}/OpenMolcas.tar.gz
INSTALL_DIR=/local/apl/lx/openmolcas21.10
GAROOT=${INSTALL_DIR}/ga-5.8 # reuse prev version's one
PARALLEL=8
WORKDIR=/work/users/${USER}
export GAROOT
#--------------------------------------------------------
umask 0022
ulimit -s unlimited
export LANG=
export LC_ALL=C
module purge
module load intel/19.1.2
module load mkl/2020.0.2
module load mpi/openmpi/3.1.0/intel20
module load cmake/3.16.3
cd $WORKDIR
if [ -d OpenMolcas ]; then
mv OpenMolcas OpenMolcas_tmp
rm -rf OpenMolcas_tmp
fi
tar zxf ${TARBALL}
cd OpenMolcas
git submodule update --init External/libmsym
git submodule update --init External/efp
git submodule update --init External/libwfa
mkdir build && cd build
export FC=mpif90
export CC=mpicc
export CXX=mpicxx
cmake .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=${INSTALL_DIR} \
-DMPI_Fortran_COMPILER=${FC} \
-DMPI_C_COMPILER=${CC} \
-DMPI_CXX_COMPILER=${CXX} \
-DMPI=ON \
-DGA=ON \
-DOPENMP=ON \
-DLINALG=MKL \
-DHDF5=ON \
-DTOOLS=ON \
-DFDE=ON \
-DEFPLIB=ON \
-DMSYM=ON \
-DNEVPT2=OFF \
-DDMRG=OFF \
-DWFA=ON
make -j${PARALLEL}
export MOLCAS_NPROCS=1
export OMP_NUM_THREADS=1
pymolcas verify
export MOLCAS_NPROCS=2
export OMP_NUM_THREADS=2
pymolcas verify
make install
テスト
OpenMolcas のテスト結果は /local/apl/lx/openmolcas21.10/test_results 以下にコピーを配置してあります。
シリアル版
- grayzone: 834 は Skipped (有効にしていない gromacs の機能に関する機能)
- 追加で WFA に関して extra/835.input を手動でテスト実行。エラーは見られない。
並列版
- standard: 全てパス
- additional: 以下のテストが Skip で、他はパス
- 310, 330, 339, 340, 341, 343, 344, 411, 806, 809, 810, 811, 812, 822, 855
- grayzone: 834 だけ Skipped.
メモ
- 基本的には v20.10 と同じ設定でビルド
- libwfa を有効にしている点以外は同じ