Molpro 2024.1.0

ウェブページ

https://www.molpro.net/

バージョン

2024.1.0

ビルド環境

  • GCC 12.1.1 (gcc-toolset-12)
  • Intel MPI 2021.11 / Open MPI 4.1.6
  • Eigen 3.4.0
  • MKL 2024.0

ビルドに必要なファイル

  • molpro-2024.1.0.tar.gz
  • ga-5.8.2.tar.gz
  • work.patch
  • patch-argos-binput.F
  • patch-cic-ItfFortranInt.h
  • patch-common_modules-common_cconf1
    • 大きな CI 計算のためのパラメータの変更と、一時ディレクトリのデフォルトの場所を変更しています。
    • パッチファイルは /apl/molpro/2024.1.0/patches 以下に置いています。
  • token

ビルド手順

#!/bin/sh

GA_VERSION=5.8.2
GA_ARCHIVE=/home/users/${USER}/Software/GlobalArrays/${GA_VERSION}/ga-${GA_VERSION}.tar.gz

MOLPRO_VERSION=2024.1.0
MOLPRO_DIRNAME=molpro-${MOLPRO_VERSION}
PARALLEL=12
BASEDIR=/home/users/${USER}/Software/Molpro/${MOLPRO_VERSION}
MOLPRO_TARBALL=${BASEDIR}/${MOLPRO_DIRNAME}.tar.gz

PATCH0=${BASEDIR}/work.patch
PATCH1=${BASEDIR}/patch-argos-binput.F
PATCH2=${BASEDIR}/patch-cic-ItfFortranInt.h
PATCH3=${BASEDIR}/patch-common_modules-common_cconf1

TOKEN=${BASEDIR}/token

WORKDIR=/gwork/users/${USER}
GA_INSTALLDIR=${WORKDIR}/ga-temporary
INSTALLDIR=/apl/molpro/${MOLPRO_VERSION}

#------------------------------------------
umask 0022
ulimit -s unlimited

export LANG=
export LC_ALL=C
export OMP_NUM_THREADS=1

cd $WORKDIR
if [ -d ga-${GA_VERSION} ]; then
  mv ga-${GA_VERSION} ga_tmp
  rm -rf ga_tmp &
fi
if [ -d ga-temporary ]; then
  mv ga-temporary ga_tmp_tmp
  rm -rf ga_tmp_tmp &
fi
if [ -d ${MOLPRO_DIRNAME} ]; then
  mv ${MOLPRO_DIRNAME} molpro_tmp
  rm -rf molpro_tmp &
fi

module -s purge
module -s load gcc-toolset/12
module -s load intelmpi/2021.11
#module -s load openmpi/4.1.6/gcc12
module -s load eigen/3.4.0

tar zxf ${GA_ARCHIVE}
cd ga-${GA_VERSION}

export CFLAGS="-mpc80"
export FFLAGS="-mpc80"
export FCFLAGS="-mpc80"
export CXXFLAGS="-mpc80"

export F77=mpif90
export F90=mpif90
export FC=mpif90
export CC=mpicc
export CXX=mpicxx
export MPIF77=mpif90
export MPICC=mpicc
export MPICXX=mpicxx
export GA_FOPT="-O3"
export GA_COPT="-O3"
export GA_CXXOPT="-O3"

./autogen.sh
./configure --enable-i8 \
            --with-mpi-pr \
            --prefix=${GA_INSTALLDIR}

make -j ${PARALLEL}
make check
make install

# mkl for molpro
module -s load mkl/2024.0

cd ${WORKDIR}
tar zxf ${MOLPRO_TARBALL}
cd ${MOLPRO_DIRNAME}

patch -p0 < ${PATCH0}
patch -p0 < ${PATCH1}
patch -p0 < ${PATCH2}
patch -p0 < ${PATCH3}

export PATH="${GA_INSTALLDIR}/bin:$PATH" # where ga-config exists

CPPFLAGS="-I${GA_INSTALLDIR}/include" \
LDFLAGS="-L${GA_INSTALLDIR}/lib64" \
   ./configure --prefix=${INSTALLDIR} \
               --enable-slater

make -j ${PARALLEL}
cp $TOKEN lib/.token

make tuning

MOLPRO_OPTIONS="" make quicktest
MOLPRO_OPTIONS="-n2" make test

make install
cp -a testjobs ${INSTALLDIR}/molpro*
cp -a bench ${INSTALLDIR}/molpro*

テスト結果

h2o_rvci_dip のテストで失敗。RVCI_DIP(4:6)の値が問題と思われる。

 SETTING RVCI_TEST(1)   =       140.24404946  CM-1                            
 SETTING RVCI_TEST(2)   =      2040.72148410  CM-1                            
 SETTING RVCI_TEST(3)   =      4309.43539874  CM-1                            
 SETTING RVCI_DIP(1)    =      6.6023777D-20                                  
 SETTING RVCI_DIP(2)    =      6.9439373D-20                                  
 SETTING RVCI_DIP(3)    =      5.6819299D-19                                  
 SETTING RVCI_DIP(4)    =      9.6702224D-20                                  
 SETTING RVCI_DIP(5)    =      1.2687290D-18                                  
 SETTING RVCI_DIP(6)    =      4.3975422D-19                                  
 SETTING RVCI_DIP(7)    =      4.5351150D-20                                  
 SETTING RVCI_DIP(8)    =      3.5013711D-19                                  
 SETTING RVCI_DIP(9)    =      1.3565481D-20                                  
 RVCI_TEST(1:3)   = [     140.24404946  2040.72148410  4309.43539874] CM-1
 SETTING RVCIFREQ_REF(1)=       140.24000000                                  
 SETTING RVCIFREQ_REF(2)=      2040.72000000                                  
 SETTING RVCIFREQ_REF(3)=      4309.44000000                                  
 SETTING RVCIDIP_REF(1) =      6.6023777D-20                                  
 SETTING RVCIDIP_REF(2) =      6.9439373D-20                                  
 SETTING RVCIDIP_REF(3) =      5.6819299D-19                                  
 SETTING RVCIDIP_REF(4) =      3.2234075D-20
 SETTING RVCIDIP_REF(5) =      4.2290966D-19                                  
 SETTING RVCIDIP_REF(6) =      1.3192627D-18                                  
 SETTING RVCIDIP_REF(7) =      4.5351150D-20                                  
 SETTING RVCIDIP_REF(8) =      3.5013711D-19                                  
 SETTING RVCIDIP_REF(9) =      1.3565481D-20                                  
 SETTING DRVCI          =         0.00460126  CM-1                            
 SETTING DRVCI_DIP      =         2.00000008

Open MPI, Intel MPI のどちらでも同じエラーが発生。
非並列にした場合や MKL のかわりに OpenBLAS を使った場合でもエラーを回避できず。gcc11 に変えても同様。

メモ

  • (上記手順で intelmpi のかわりに openmpi の行を有効にすればそのまま利用できます。)
  • Intel MPI を使うとシングルノードのデフォルト設定である disk option で今のところ問題が発生していない
    • Open MPI の場合には disk option を使った場合にフリーズする場合がある。
    • (disk option を使った場合計算時間が短くなることがあるが、逆に遅くなる場合もある。)
  • Open MPI を使った時の方が平均的に速度が出るように見える。一方で disk option 時にフリーズの危険がある。そのため、インテル MPI 版を標準のバージョンとしている。
  • Eigen 3.3 ではビルドできなかったため、Eigen 3.4.0 を利用
    • mkl+eigen 3.3 の場合は configure でエラー、openblas+eigen 3.3 の場合はビルド中にエラー
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